Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR3O43731 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms