Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNAB3O43448 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms