Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTIFO43310 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTIFO43310 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTIFO43310 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTIFO43310 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTIFO43310 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTIFO43310 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTIFO43310 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTIFO43310 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTIFO43310 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTIFO43310 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTIFO43310 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTIFO43310 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTIFO43310 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTIFO43310 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTIFO43310 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTIFO43310 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTIFO43310 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTIFO43310 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTIFO43310 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTIFO43310 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTIFO43310 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTIFO43310 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTIFO43310 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTIFO43310 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTIFO43310 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTIFO43310 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTIFO43310 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTIFO43310 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTIFO43310 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTIFO43310 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTIFO43310 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTIFO43310 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTIFO43310 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTIFO43310 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTIFO43310 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTIFO43310 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTIFO43310 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTIFO43310 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTIFO43310 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTIFO43310 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTIFO43310 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTIFO43310 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTIFO43310 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTIFO43310 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTIFO43310 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTIFO43310 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTIFO43310 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTIFO43310 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTIFO43310 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTIFO43310 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTIFO43310 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTIFO43310 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTIFO43310 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTIFO43310 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTIFO43310 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTIFO43310 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTIFO43310 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTIFO43310 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTIFO43310 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTIFO43310 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTIFO43310 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTIFO43310 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTIFO43310 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTIFO43310 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTIFO43310 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTIFO43310 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTIFO43310 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTIFO43310 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTIFO43310 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTIFO43310 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTIFO43310 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTIFO43310 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTIFO43310 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTIFO43310 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTIFO43310 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTIFO43310 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTIFO43310 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTIFO43310 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTIFO43310 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTIFO43310 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTIFO43310 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTIFO43310 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTIFO43310 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTIFO43310 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTIFO43310 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTIFO43310 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTIFO43310 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTIFO43310 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTIFO43310 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTIFO43310 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTIFO43310 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTIFO43310 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTIFO43310 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTIFO43310 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTIFO43310 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTIFO43310 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTIFO43310 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTIFO43310 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTIFO43310 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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