Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC27A2O14975 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A2O14975 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms