Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms