Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EBAG9O00559 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms