Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QQQ9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QQQ9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QQQ9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QQQ9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QQQ9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QQQ9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QQQ9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QQQ9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QQQ9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QQQ9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QQQ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QQQ9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QQQ9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QQQ9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QQQ9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QQQ9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QQQ9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QQQ9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QQQ9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QQQ9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QQQ9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QQQ9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QQQ9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QQQ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms