Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C0C1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C0C1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C0C1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C0C1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C0C1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C0C1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C0C1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C0C1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C0C1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C0C1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C0C1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C0C1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C0C1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C0C1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C0C1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C0C1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C0C1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C0C1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C0C1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C0C1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C0C1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0C1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0C1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0C1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0C1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0C1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0C1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0C1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0C1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0C1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0C1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0C1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0C1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H7C0C1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
H7C0C1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C0C1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C0C1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C0C1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C0C1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0C1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0C1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0C1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0C1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0C1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0C1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0C1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0C1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0C1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0C1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0C1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0C1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0C1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0C1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0C1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0C1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0C1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0C1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0C1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0C1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0C1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0C1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0C1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0C1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0C1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0C1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0C1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms