Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GOLGA8SH3BPF8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA8SH3BPF8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms