Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP99D6REC4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms