Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KIF28PB7ZC32 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF28PB7ZC32 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms