Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HSPB2A8KAH6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB2A8KAH6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms