Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms