Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms