Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC162PA2VCL2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms