Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPAARA0A1B0GVQ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPAARA0A1B0GVQ0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms