Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 AC004832.1-204ENST00000610737 1018 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTKP29376 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 HSD17B3-201ENST00000375262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 PRKCE-202ENST00000394874 996 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 PHBP11-201ENST00000420550 809 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 AC004870.4-202ENST00000433337 455 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 TSACC-206ENST00000466306 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 CLDND1-223ENST00000511081 642 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 MUTYH-236ENST00000529984 1029 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 AC007731.1-203ENST00000583722 474 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 AKTIP-201ENST00000300245 2133 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTKP29376 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 MPI-212ENST00000565576 1148 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTKP29376 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTKP29376 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTKP29376 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTKP29376 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTKP29376 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTKP29376 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTKP29376 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LTKP29376 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTKP29376 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTKP29376 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTKP29376 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTKP29376 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTKP29376 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 AC006262.1-201ENST00000593980 1316 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTKP29376 KRT41P-201ENST00000393988 1293 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms