Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms