Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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