Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL512791.2-201ENST00000615251 4609 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 INPP5D-204ENST00000445964 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms