Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AL121761.1-203ENST00000426012 677 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 IQCF5-201ENST00000446461 512 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 ZNF7-209ENST00000529819 513 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 SELENOS-207ENST00000531964 764 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 AC008761.2-201ENST00000600512 419 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 AC079882.1-201ENST00000609433 375 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 AC024580.2-201ENST00000623363 231 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 BCCIP-201ENST00000278100 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 PQLC2L-204ENST00000459838 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 AC104371.1-201ENST00000522077 797 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 AC022239.3-201ENST00000528629 544 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 MIR4294-201ENST00000584548 76 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 AC022748.2-203ENST00000564933 1432 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 CNTF-201ENST00000361987 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 KRT31-201ENST00000251645 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 NCR1-205ENST00000594765 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 QRFPR-201ENST00000334383 1215 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 RPL23-203ENST00000394332 625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 HNRNPA1P24-201ENST00000476029 1046 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 ZEB2P1-201ENST00000515048 1141 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 HTR4-210ENST00000521735 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 MEG3-223ENST00000524131 721 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 RPL23-207ENST00000577407 615 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 AC093323.3-201ENST00000632627 949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 CLK4-208ENST00000520957 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NESP48681 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 CLASP2-201ENST00000313350 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 WDSUB1-204ENST00000409124 1600 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 RGPD4-AS1-202ENST00000457647 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 KRTAP19-2-201ENST00000334055 380 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 AL355994.4-201ENST00000416882 563 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 AP005901.1-201ENST00000508721 1181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 SAP30L-AS1-202ENST00000519727 396 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 TINF2-210ENST00000559019 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 AP000894.2-203ENST00000580612 439 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 ZNF548-207ENST00000597400 589 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 AP002986.1-203ENST00000602310 330 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 AC007378.1-201ENST00000609765 478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NESP48681 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 AC078850.1-201ENST00000514265 1623 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 TROAP-202ENST00000380327 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 AC006022.1-201ENST00000425261 388 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 AL139220.1-201ENST00000436802 520 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 AC008870.3-201ENST00000566143 641 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 LINC01206-212ENST00000609168 988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 AP003419.3-201ENST00000613900 527 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 AL353626.2-201ENST00000615372 130 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms