Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GGCXP38435 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GGCXP38435 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GGCXP38435 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GGCXP38435 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GGCXP38435 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GGCXP38435 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GGCXP38435 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GGCXP38435 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GGCXP38435 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GGCXP38435 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GGCXP38435 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GGCXP38435 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GGCXP38435 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GGCXP38435 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms