Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC068338.3-201ENST00000617892 418 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 APOBEC3B-203ENST00000402182 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 WDR24-202ENST00000293883 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 STXBP1-220ENST00000637521 2068 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 GAL3ST4-203ENST00000413800 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC092117.2-201ENST00000623937 1659 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 WDR83OS-202ENST00000596731 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms