Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms