Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms