Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MYT1-202ENST00000360149 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MMP19-206ENST00000548629 1813 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ALPL-203ENST00000374832 2193 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZFHX2-AS1-201ENST00000553985 2322 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms