Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC073488.1-201ENST00000416620 1600 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms