Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms