Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ALDH7A1-228ENST00000636886 2321 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GRAMD1B-202ENST00000450171 2431 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CPEB3-202ENST00000412050 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms