Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINC1P01008 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms