Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 IL1R2-202ENST00000393414 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 RUNX2-AS1-201ENST00000563807 1513 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC102953.1-201ENST00000445345 498 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms