Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC3P51654 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPC3P51654 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPC3P51654 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPC3P51654 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPC3P51654 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPC3P51654 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPC3P51654 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPC3P51654 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPC3P51654 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPC3P51654 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPC3P51654 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms