Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GGCXP38435 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms