Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 KRBOX4-203ENST00000377919 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 FTH1P19-201ENST00000402402 528 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 B3GALNT1-204ENST00000417187 1107 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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