Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 DEFB103A-201ENST00000314357 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 DEFB103B-201ENST00000318124 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 AL157702.2-201ENST00000428292 1223 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PF4P02776 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PF4P02776 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PF4P02776 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PF4P02776 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 TMEM59-201ENST00000234831 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PF4P02776 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PF4P02776 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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