Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CIZ1-225ENST00000538431 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 OTUD6B-206ENST00000617869 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC026369.2-201ENST00000540136 1101 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC068338.3-201ENST00000617892 418 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 EVL-214ENST00000555048 1715 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 STXBP1-220ENST00000637521 2068 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ZUFSP-202ENST00000368576 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ELP4-212ENST00000638764 2456 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ACSBG2-202ENST00000586696 2739 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TP53-222ENST00000617185 2724 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ANXA4-201ENST00000394295 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 DERL1-201ENST00000259512 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 KLF11-206ENST00000540845 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SCNN1A-203ENST00000360168 3481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ASIC2-202ENST00000359872 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AVIL-201ENST00000257861 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ZNF627-201ENST00000361113 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 FUT6-203ENST00000524754 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RAI2-202ENST00000360011 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RFX5-215ENST00000452671 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ZNF814-215ENST00000614383 2006 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 IL1R2-202ENST00000393414 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 FAM78A-202ENST00000372269 3659 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC01070-201ENST00000561786 2829 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 CCDC138-201ENST00000295124 2383 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ALAS1-201ENST00000310271 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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