Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 RDH16-202ENST00000398138 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AL031714.1-201ENST00000567829 2926 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 IL1R2-201ENST00000332549 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 TSPYL2-201ENST00000375442 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 TRIM32-203ENST00000450136 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 KIR3DL1-201ENST00000326542 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNFSF18Q9UNG2 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms