Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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LMO3Q8TAP4 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LMO3Q8TAP4 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LMO3Q8TAP4 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LMO3Q8TAP4 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LMO3Q8TAP4 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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