Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms