Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PGAP2-235ENST00000532523 1696 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 ACVR1C-202ENST00000335450 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 AC092295.2-201ENST00000592087 1392 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 GPHN-202ENST00000459628 1723 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 GNLY-201ENST00000263863 846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 PPP3CB-AS1-201ENST00000422977 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 SYP-AS1-201ENST00000433499 542 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 AC073465.1-201ENST00000456671 464 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 AC027237.4-201ENST00000560870 694 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 B9D1-213ENST00000575403 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 LINC00470-211ENST00000584492 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 AC127526.5-201ENST00000637148 1110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 TUBD1-203ENST00000346141 1490 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 EIF3LP1-201ENST00000554099 1658 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 DMKN-202ENST00000392206 458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 SOX2-OT-201ENST00000460739 609 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 LINC01324-202ENST00000497379 838 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 NDUFA13-204ENST00000507754 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 CYB561A3-213ENST00000539890 572 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 RHOJ-202ENST00000555125 548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 AL133297.2-201ENST00000563162 485 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 IGHV1OR16-2-201ENST00000564937 349 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 AC140658.2-201ENST00000566360 348 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 AL157392.3-218ENST00000600249 773 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NESP48681 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NESP48681 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NESP48681 ZNF772-209ENST00000615214 1506 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NESP48681 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 NAA50-203ENST00000477813 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 CYTH4-202ENST00000402997 633 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 AC004771.2-201ENST00000430920 439 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 AL132709.1-202ENST00000448840 588 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 AC069181.1-201ENST00000498256 554 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 AC113346.2-201ENST00000502684 457 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 AC245884.7-201ENST00000514037 356 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 AC021678.2-201ENST00000521731 887 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 TRAPPC4-209ENST00000528230 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 AP000553.1-201ENST00000610143 430 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 FURIN-208ENST00000640725 224 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NESP48681 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 AC034238.1-214ENST00000609699 1590 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 RCL1-203ENST00000381732 804 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 OR2A5-201ENST00000408906 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 AL357060.2-204ENST00000448942 963 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 AC008676.2-201ENST00000519499 741 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms