Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EPB42P16452 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms