Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VIL1P09327 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VIL1P09327 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VIL1P09327 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms