Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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USP35Q9P2H5 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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USP35Q9P2H5 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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