Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CABP7Q86V35 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CABP7Q86V35 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms