Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TSEN2-204ENST00000415684 2279 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CPEB4-207ENST00000519835 2257 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 STAT6-220ENST00000556155 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GRPEL1-201ENST00000264954 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA13-205ENST00000409126 2111 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 XRCC6-206ENST00000428575 2148 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL132656.4-201ENST00000623504 2122 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TWNK-201ENST00000311916 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CDH4-201ENST00000543233 3117 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ELP2-201ENST00000350494 2487 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 POM121B-201ENST00000380760 2487 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF839-206ENST00000558850 2971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC027801.2-201ENST00000515692 1816 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PDCD4-202ENST00000393104 3697 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DIS3L2-204ENST00000409307 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC073133.2-201ENST00000436670 2698 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ABCF2-201ENST00000222388 2185 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ALPL-203ENST00000374832 2193 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 STRADA-231ENST00000638708 2153 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KRT25-201ENST00000312150 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC023830.2-201ENST00000563704 1662 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GMEB2-202ENST00000370069 4011 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 STPG1-201ENST00000003583 2544 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 COL25A1-202ENST00000399127 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC108058.1-201ENST00000457290 2044 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DMBX1-202ENST00000371956 2882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SAMMSON-206ENST00000641053 1516 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RAI2-202ENST00000360011 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PEX5L-213ENST00000476138 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NRIP2-201ENST00000337508 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms