Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms