Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX6O43752 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX6O43752 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms