Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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