Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms