Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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